del I
En kraftfull räv kallas nio-svansar angriper Konoha, den dolda byn i Eldslandet, en av de fem stora Shinobi länder i Ninja världen. Som svar, ledare för Konoha, den fjärde Hokage, tätar räven inuti kroppen av sin nyfödde son, Naruto Uzumaki, på bekostnad av faderns liv, vilket gör Naruto en Jinchuriki av odjuret. Som barn är Naruto isoleras från Konoha samhället, som betraktar honom som om han var nio-svansar. Ett dekret som Naruto Costumes gjorts av ledaren den tredje Hokage förbjuder någon att nämna nio-stjärtar till någon annan. Tolv år senare, avfälling ninja Mizuki avslöjar sanningen till Naruto innan att besegras av honom med skugga klon Jutsu teknik, tjänar respekt för sin lärare Iruka Umino. Strax efter, blir Naruto en ninja och tilldelas tillsammans med Sasuke Uchiha, som han ofta tävlar mot, och Sakura Haruno, på vilken han har en fruktdryck, för att bilda en grupp på tre personer, lag 7, enligt en erfaren sensei, eliten ninja Kakashi Hatake. Liksom alla ninja lag från varje by, är Team 7 laddas med att slutföra uppdrag som begärts av byborna, allt från att göra sysslor och vara livvakter till artis mord.
Efter flera uppdrag, främst en till delstaten Vågor tillåter Kakashi Team 7 att delta i en ninja examen som ger dem möjlighet att gå Naruto Costumes vidare till en högre rang och därmed delta i svårare uppdrag. Under proven, Orochimaru, en efterlyst brottsling, invaderar Konoha och dödar den tredje Hokage för hämnd. Detta tvingar en av de tre legendariska ninja, Jiraiya, för att söka med Naruto för Tsunade som har nominerats till att bli det femte Hokage. Under sökningen, är det visat att Orochimaru önskar förvärva Sasuke på grund av sin starka genetiska arv, Sharingan. Tro Orochimaru kommer att kunna ge honom den Naruto Costumes styrka som krävs för att döda hans äldre bror Itachi (som förstörde deras klan), ansluter Sasuke småningom honom efter ett förödmjukande nederlag av hans bror. Tsunade sänder en grupp av ninja, inklusive Naruto, för att hämta Sasuke, men Naruto är oförmögen att föra honom tillbaka till byn. Men Naruto och Sakura inte ge upp Sasuke. Naruto lämnar Konoha att träna enligt Jiraiya förmyndarskap att förbereda sig för nästa gång han möter Sasuke, medan Sakura blir Tsunade lärling.
